Resumen:
La filogeografía es la disciplina encargada de examinar la distribución de los linajes de genes, es importante realizar estos estudios para el conocimiento y conservación dela biodiversidad, particularmente de los mamíferos mexicanos, ya que permiten entender mejor los procesos temporales, espaciales y evolutivos de sus poblaciones con el fin de preservarlas a corto y largo plazo. La rata canguro de Phillips (Dipodomys phillipsii)contiene a tres subespecies, de las cuales D. p. oaxacae es la que tiene la distribución más sureña. Dipodomys phillipsii se encuentra amenazada de acuerdo conlaNOM-059, debido al cambio de uso de suelo y a la destrucción de su hábitat.El escaso conocimiento de los aspectos genéticos de dicho roedor ha dificultado el establecimiento de las estrategias efectivas para su conservación. El objetivo de este trabajo fue determinar el patrón filogeográfico de las poblaciones de D. phillipsii y estimar su divergencia genética con base en ADN mitocondrial(cytb). Realizamos análisis de máxima verosimilitud e inferencia bayesiana. Recuperamos dos clados distintos, uno conformado por D. p.perotensis-D. p. phillipsii y el segundo por D. p.oaxacae. Ambos, presentan consistencia geográfica. D. phillipsii es un grupo monofilético, con especiación simpátrica. De acuerdo con nuestras estimaciones el tiempo de divergencia entre ambos clados (uno que habita en las provincia de la Faja Volcánica Transmexicana y el otro en la provincia de la Depresión del Balsas), fue de 2.02 millones de años con un nivel de divergencia del 2.8% sustituciones por sitio.